Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pop5Q9DB28 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms