Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms