Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Atg7Q9D906 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Atg7Q9D906 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg7Q9D906 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg7Q9D906 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg7Q9D906 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atg7Q9D906 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms