Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms