Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D7E4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D7E4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D7E4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D7E4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D7E4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D7E4 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D7E4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D7E4 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Q9D7E4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms