Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
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Cldn23Q9D7D7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Cldn23Q9D7D7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Cldn23Q9D7D7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Cldn23Q9D7D7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Cldn23Q9D7D7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Cldn23Q9D7D7 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms