Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klhl40Q9D783 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhl40Q9D783 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms