Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs6Q9D6W8 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms