Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm5Q9D6G9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms