Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms