Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc81Q9D5W4 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms