Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm3404Q9D506 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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