Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms