Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms