Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms