Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J1

Necap2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necap2Q9D1J1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Necap2Q9D1J1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Necap2Q9D1J1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Necap2Q9D1J1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Necap2Q9D1J1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Necap2Q9D1J1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Necap2Q9D1J1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Necap2Q9D1J1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Necap2Q9D1J1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Necap2Q9D1J1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Necap2Q9D1J1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Necap2Q9D1J1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Necap2Q9D1J1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Necap2Q9D1J1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Necap2Q9D1J1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Necap2Q9D1J1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Necap2Q9D1J1 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Necap2Q9D1J1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Necap2Q9D1J1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Necap2Q9D1J1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Necap2Q9D1J1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Necap2Q9D1J1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Necap2Q9D1J1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Necap2Q9D1J1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Necap2Q9D1J1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Necap2Q9D1J1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Necap2Q9D1J1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Necap2Q9D1J1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Necap2Q9D1J1 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Necap2Q9D1J1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Necap2Q9D1J1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Necap2Q9D1J1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Necap2Q9D1J1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Necap2Q9D1J1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Necap2Q9D1J1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Necap2Q9D1J1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Necap2Q9D1J1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Necap2Q9D1J1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Necap2Q9D1J1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Necap2Q9D1J1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Necap2Q9D1J1 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Necap2Q9D1J1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Necap2Q9D1J1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Necap2Q9D1J1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms