Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmbr1lQ9D1E5 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lmbr1lQ9D1E5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lmbr1lQ9D1E5 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lmbr1lQ9D1E5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lmbr1lQ9D1E5 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmbr1lQ9D1E5 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmbr1lQ9D1E5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmbr1lQ9D1E5 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmbr1lQ9D1E5 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmbr1lQ9D1E5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmbr1lQ9D1E5 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmbr1lQ9D1E5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmbr1lQ9D1E5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmbr1lQ9D1E5 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmbr1lQ9D1E5 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmbr1lQ9D1E5 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmbr1lQ9D1E5 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmbr1lQ9D1E5 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmbr1lQ9D1E5 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmbr1lQ9D1E5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmbr1lQ9D1E5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmbr1lQ9D1E5 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmbr1lQ9D1E5 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmbr1lQ9D1E5 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmbr1lQ9D1E5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmbr1lQ9D1E5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmbr1lQ9D1E5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmbr1lQ9D1E5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmbr1lQ9D1E5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmbr1lQ9D1E5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmbr1lQ9D1E5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmbr1lQ9D1E5 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms