Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms