Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rfc5Q9D0F6 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rfc5Q9D0F6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rfc5Q9D0F6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rfc5Q9D0F6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rfc5Q9D0F6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rfc5Q9D0F6 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rfc5Q9D0F6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rfc5Q9D0F6 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rfc5Q9D0F6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rfc5Q9D0F6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rfc5Q9D0F6 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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