Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Snf8Q9CZ28 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Snf8Q9CZ28 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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