Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYI0 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYI0 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYI0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYI0 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYI0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CYI0 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CYI0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CYI0 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CYI0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CYI0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CYI0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CYI0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms