Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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