Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9CWU4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9CWU4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9CWU4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9CWU4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9CWU4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9CWU4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CWU4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CWU4 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q9CWU4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms