Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Ddx28Q9CWT6 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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Ddx28Q9CWT6 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ddx28Q9CWT6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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