Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Pfdn1Q9CWM4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pfdn1Q9CWM4 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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