Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Ifitm3Q9CQW9 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Ifitm3Q9CQW9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
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Ifitm3Q9CQW9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
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Ifitm3Q9CQW9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Ifitm3Q9CQW9 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifitm3Q9CQW9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms