Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Use1Q9CQ56 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Use1Q9CQ56 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Use1Q9CQ56 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms