Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chmp3Q9CQ10 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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