Protein–RNA interactions for Protein: Q99PT3

Ino80b, INO80 complex subunit B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80bQ99PT3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80bQ99PT3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms