Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms