Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Sh3bp5lQ99LH9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Sh3bp5lQ99LH9 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Sh3bp5lQ99LH9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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