Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms