Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms