Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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TrabdQ99JY4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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TrabdQ99JY4 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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TrabdQ99JY4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TrabdQ99JY4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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