Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GatbQ99JT1 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms