Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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Smim11aQ99J19 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Smim11aQ99J19 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Smim11aQ99J19 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Smim11aQ99J19 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Smim11aQ99J19 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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