Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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