Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms