Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Pde6cQ91ZQ1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Pde6cQ91ZQ1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Pde6cQ91ZQ1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Pde6cQ91ZQ1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Pde6cQ91ZQ1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Pde6cQ91ZQ1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Pde6cQ91ZQ1 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde6cQ91ZQ1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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