Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD6

Vps36, Vacuolar protein-sorting-associated protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps36Q91XD6 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps36Q91XD6 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms