Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp4Q8VHC5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms