Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Uhrf1Q8VDF2 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Uhrf1Q8VDF2 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Uhrf1Q8VDF2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Uhrf1Q8VDF2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Uhrf1Q8VDF2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Uhrf1Q8VDF2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Uhrf1Q8VDF2 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Uhrf1Q8VDF2 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Uhrf1Q8VDF2 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Uhrf1Q8VDF2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Uhrf1Q8VDF2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Uhrf1Q8VDF2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Uhrf1Q8VDF2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Uhrf1Q8VDF2 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Uhrf1Q8VDF2 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms