Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD62

Bles03, UPF0696 protein C11orf68 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bles03Q8VD62 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Bles03Q8VD62 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms