Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCQ6

Sgms1, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms1Q8VCQ6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Sgms1Q8VCQ6 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Sgms1Q8VCQ6 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Sgms1Q8VCQ6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Sgms1Q8VCQ6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Sgms1Q8VCQ6 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Sgms1Q8VCQ6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Sgms1Q8VCQ6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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