Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC66

Ssx2ip, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx2ipQ8VC66 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx2ipQ8VC66 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx2ipQ8VC66 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx2ipQ8VC66 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx2ipQ8VC66 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx2ipQ8VC66 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx2ipQ8VC66 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx2ipQ8VC66 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx2ipQ8VC66 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx2ipQ8VC66 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx2ipQ8VC66 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx2ipQ8VC66 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx2ipQ8VC66 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx2ipQ8VC66 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx2ipQ8VC66 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx2ipQ8VC66 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx2ipQ8VC66 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx2ipQ8VC66 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx2ipQ8VC66 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx2ipQ8VC66 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx2ipQ8VC66 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx2ipQ8VC66 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx2ipQ8VC66 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx2ipQ8VC66 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx2ipQ8VC66 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx2ipQ8VC66 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx2ipQ8VC66 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx2ipQ8VC66 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx2ipQ8VC66 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx2ipQ8VC66 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx2ipQ8VC66 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx2ipQ8VC66 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx2ipQ8VC66 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx2ipQ8VC66 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx2ipQ8VC66 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx2ipQ8VC66 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx2ipQ8VC66 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx2ipQ8VC66 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx2ipQ8VC66 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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