Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BbxQ8VBW5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms