Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.5 ms