Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3C0

Mcmbp, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
McmbpQ8R3C0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
McmbpQ8R3C0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms