Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms