Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Hoxc12Q8K5B8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Hoxc12Q8K5B8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Hoxc12Q8K5B8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Hoxc12Q8K5B8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Hoxc12Q8K5B8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Hoxc12Q8K5B8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Hoxc12Q8K5B8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Hoxc12Q8K5B8 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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